กรมแพทย์ทหารเรือ ได้ดำเนินการโครงการสวัสดิการรักษาพยาบาลของข้าราชการ ลูกจ้างประจำ และบุคคลในครอบครัว โดยเมื่อเข้ารับการรักษาแบบผู้ป่วยนอกไม่ต้องชำระเงินสด ซึ่งขณะนี้สามารถทำบัตรสีฟ้าในโครงการสวัสดิการรักษาพยาบาลโดยไม่ต้องชำระเงินสดได้แล้ว และสามารถใช้บริการในโรงพยาบาลสังกัดกองทัพเรือที่เข้าร่วมโครงการได้แก่ โรงพยาบาลสมเด็จพระปิ่นเกล้า โรงพยาบาลสมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ โรงพยาบาลอาภากรเกียรติวงศ์ โรงพยาบาลทหารเรือกรุงเทพ โรงพยาบาลสรรพาวุธทหารเรือ โรงพยาบาลโรงเรียนนายเรือ โรงพยาบาลฐานทัพเรือสงขลา